Thông tư 91/2026/TT-BTC và 5 điểm mới quan trọng cần lưu ý về hóa đơn

Thông tư 91/2026/TT-BTC được Bộ Tài chính ban hành ngày 30/06/2026, có hiệu lực từ ngày 01/07/2026 và thay thế Thông tư 32/2025/TT-BTC. Với các nội dung mới liên quan đến hóa đơn, chứng từ điện tử, xác thực sinh trắc học, kết nối dữ liệu dân cư quốc gia và tiêu chí quản lý rủi ro thuế, văn bản này có tác động trực tiếp đến doanh nghiệp, hộ kinh doanh, kế toán và người nộp thuế trong quá trình đăng ký, sử dụng, điều chỉnh và quản lý hóa đơn điện tử.

Trong bài viết này, Atax tổng hợp các điểm mới quan trọng của Thông tư 91/2026/TT-BTC theo hướng rõ ràng, hệ thống và dễ áp dụng, giúp doanh nghiệp chủ động rà soát quy trình nội bộ, hạn chế sai sót về hóa đơn và bảo đảm tuân thủ quy định thuế hiện hành.

Tổng quan về Thông tư 91/2026/TT-BTC

Ngày 30/06/2026, Bộ Tài chính đã chính thức ban hành Thông tư 91/2026/TT-BTC quy định về hóa đơn, chứng từ điện tử. Thông tư có hiệu lực từ ngày 01/07/2026 và thay thế toàn bộ Thông tư 32/2025/TT-BTC.

Số hiệu văn bản	Thông tư 91/2026/TT-BTC
Loại văn bản	Thông tư
Cơ quan ban hành	Bộ Tài chính
Ngày ban hành	30/06/2026
Ngày có hiệu lực	01/07/2026
Lĩnh vực	Thuế, hóa đơn, chứng từ điện tử
Văn bản bị thay thế	Thông tư 32/2025/TT-BTC
Căn cứ pháp lý	Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15; Nghị định số 254/2026/NĐ-CP

Theo đánh giá của Atax, Thông tư 91/2026/TT-BTC không chỉ điều chỉnh kỹ thuật lập và xử lý hóa đơn điện tử mà còn thể hiện định hướng tăng cường quản lý thuế trên nền tảng dữ liệu số. Do đó, doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý các quy định về xác thực thông tin, tiêu chí rủi ro và xử lý hóa đơn sai sót.

Những điểm mới quan trọng trong Thông tư 91/2026/TT-BTC

Ứng dụng công nghệ sinh trắc học trong đăng ký hóa đơn

Một trong những điểm mới đáng chú ý của Thông tư 91/2026/TT-BTC là việc bổ sung cơ chế ứng dụng công nghệ sinh trắc học trong quá trình đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử.

Theo quy định mới, khi người nộp thuế đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử, nếu thông tin đối chiếu không khớp đúng hoặc người nộp thuế không xác nhận đúng thời hạn, cơ quan thuế có quyền áp dụng công nghệ sinh trắc học để xác thực danh tính của người đại diện theo pháp luật hoặc chủ hộ kinh doanh.

Quy định này nhằm tăng cường kiểm soát rủi ro trong đăng ký hóa đơn điện tử, hạn chế tình trạng sử dụng thông tin không chính xác, mạo danh người đại diện hoặc thành lập doanh nghiệp nhằm mục đích mua bán hóa đơn bất hợp pháp.

So sánh với Thông tư 32:

Xác thực danh tính	Đối chiếu thông tin thông thường	Bổ sung xác thực sinh trắc học
Thời hạn xử lý	Chuyển đổi trong 10 ngày nếu thuộc diện rủi ro	Tự động xử lý trong 01 ngày làm việc khi thông tin khớp đúng

Atax lưu ý doanh nghiệp cần rà soát đầy đủ thông tin đăng ký thuế, thông tin người đại diện theo pháp luật, địa chỉ trụ sở và dữ liệu định danh để hạn chế trường hợp hồ sơ bị đưa vào diện phải xác minh bổ sung.

Thắt chặt tiêu chí xác định rủi ro cao về thuế

Thông tư 91/2026/TT-BTC cụ thể hóa hơn các dấu hiệu rủi ro trong quản lý hóa đơn điện tử, đặc biệt là việc liên thông dữ liệu với các hệ thống cơ sở dữ liệu nhà nước để kiểm tra thông tin của người nộp thuế.

• Liên kết dữ liệu dân cư quốc gia: Hệ thống đối chiếu trực tiếp với Cơ sở dữ liệu quốc gia về dân cư và Hệ thống định danh, xác thực điện tử để kiểm tra địa chỉ trụ sở và thông tin người đại diện.

• Phòng chống rửa tiền: Người nộp thuế có thể bị xếp vào diện rủi ro nếu chủ sở hữu hoặc người đại diện thuộc danh sách giao dịch đáng ngờ theo Luật Phòng, chống rửa tiền.

• Địa điểm kinh doanh: Các trường hợp đăng ký trụ sở tại chung cư không được phép kinh doanh hoặc không có địa chỉ cụ thể cũng thuộc nhóm cần được theo dõi, đánh giá rủi ro.

Việc thắt chặt tiêu chí rủi ro cho thấy cơ quan thuế đang chuyển mạnh sang quản lý dựa trên dữ liệu, trong đó tính chính xác của thông tin đăng ký doanh nghiệp và thông tin thuế đóng vai trò rất quan trọng. Atax khuyến nghị doanh nghiệp thường xuyên kiểm tra tính thống nhất giữa hồ sơ đăng ký kinh doanh, hồ sơ thuế, thông tin định danh và địa chỉ hoạt động thực tế.

Biện pháp khuyến khích người mua lấy hóa đơn và tố giác hành vi sai phạm

Thông tư 91 quy định cụ thể về việc sử dụng cơ sở dữ liệu hóa đơn điện tử để triển khai các hoạt động khuyến khích người tiêu dùng lấy hóa đơn, đồng thời tăng cường cơ chế tiếp nhận thông tin phản ánh, tố giác hành vi vi phạm về hóa đơn.

Đối tượng và hình thức khuyến khích

• Cơ quan thuế tổ chức chương trình “Hóa đơn may mắn” định kỳ hàng tháng và cuối năm.

• Chương trình áp dụng đối với hóa đơn điện tử có người mua là người tiêu dùng cá nhân.

• Hình thức trao thưởng được thực hiện bằng tiền.

• Có thể bổ sung các biện pháp khuyến khích khác tùy theo tình hình thực tế để tăng tính lan tỏa và thu hút người dân tham gia.

Hạn mức kinh phí thực hiện

So với quy định trước đây, Thông tư 91/2026/TT-BTC quy định cụ thể hơn về kinh phí thực hiện các biện pháp khuyến khích người mua lấy hóa đơn. Theo đó, mức kinh phí thực hiện không quá 150 tỷ đồng/năm.

Nguồn kinh phí được ưu tiên bảo đảm từ dự toán chi quản lý hành chính của cơ quan thuế và ngân sách nhà nước hằng năm. Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế có trách nhiệm xây dựng phương án tổ chức, tần suất quay thưởng và giá trị giải thưởng cụ thể để báo cáo Bộ trưởng Bộ Tài chính.

Khen thưởng người tiêu dùng tố giác hành vi sai phạm

Thông tư 91 chính thức hóa quy trình khen thưởng đối với cá nhân cung cấp thông tin về hành vi người bán không lập hoặc không giao hóa đơn.

• Cơ quan thuế tiếp nhận thông tin tố giác từ người tiêu dùng, phân loại thông tin để kiểm tra và xác minh.

• Hồ sơ làm căn cứ khen thưởng bao gồm: tài liệu, chứng cứ về hành vi vi phạm; kết luận kiểm tra hoặc quyết định xử lý vi phạm hành chính về hóa đơn của cơ quan có thẩm quyền; thông tin của cá nhân cung cấp thông tin.

• Quyết định khen thưởng chỉ được ban hành khi cá nhân cung cấp thông tin đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định tại Điều 41 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP.

Trách nhiệm của cơ quan thuế

• Cơ quan thuế các cấp lập hồ sơ đề nghị khen thưởng đối với các trường hợp thuộc phạm vi quản lý.

• Cục trưởng cục Thuế hướng dẫn cụ thể việc tổ chức tiếp nhận tin tố giác, quản lý và sử dụng kinh phí khen thưởng đúng mục đích, công khai, minh bạch.

Đối với doanh nghiệp bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ trực tiếp cho người tiêu dùng, Atax khuyến nghị cần thiết lập quy trình lập và giao hóa đơn đầy đủ, đúng thời điểm, tránh phát sinh rủi ro bị phản ánh hoặc xử phạt vi phạm hành chính về hóa đơn.

Quy định chi tiết hơn về xử lý hóa đơn sai sót

Điều 10 của Thông tư 91/2026/TT-BTC quy định chi tiết về việc xử lý hóa đơn điện tử đã lập khi có sai sót. Đây là nội dung kế toán doanh nghiệp cần đặc biệt quan tâm vì ảnh hưởng trực tiếp đến kê khai thuế, ghi nhận doanh thu, chi phí và chứng từ kế toán.

a. Trường hợp sai tên, địa chỉ, số tiền bằng chữ hoặc nội dung khác nhưng không sai mã số thuế, số tiền, thuế suất, tiền thuế hoặc hàng hóa

Trường hợp hóa đơn có sai sót về tên, địa chỉ, số tiền bằng chữ hoặc các nội dung khác nhưng không sai về mã số thuế, số tiền ghi trên hóa đơn, thuế suất, tiền thuế hoặc hàng hóa ghi trên hóa đơn thì xử lý như sau:

• Cách xử lý: Người bán thông báo cho người mua về việc hóa đơn có sai sót và không phải lập lại hóa đơn.

• Thủ tục với cơ quan thuế: Người bán thực hiện thông báo với cơ quan thuế về hóa đơn điện tử có sai sót theo Mẫu số 04/SS-HĐĐT tại Phụ lục III, trừ trường hợp hóa đơn điện tử không có mã chưa gửi dữ liệu cho cơ quan thuế.

b. Trường hợp sai mã số thuế, số tiền, thuế suất, tiền thuế hoặc quy cách, chất lượng hàng hóa

Đối với trường hợp sai mã số thuế, số tiền, thuế suất, tiền thuế hoặc quy cách, chất lượng hàng hóa, người bán được lựa chọn một trong hai phương thức xử lý:

• Lập hóa đơn điều chỉnh: Hóa đơn phải có dòng chữ “Điều chỉnh cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… số… ngày… tháng… năm”.

• Lập hóa đơn thay thế: Hóa đơn phải có dòng chữ “Thay thế cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… số… ngày… tháng… năm”.

Điểm mới nổi bật:

• Nếu trong tháng người bán có nhiều hóa đơn sai sót cùng nội dung cho cùng một người mua, người bán được lập một hóa đơn điều chỉnh hoặc thay thế cho nhiều hóa đơn này, kèm theo Bảng kê các hóa đơn sai sót theo Mẫu số 01/BK-ĐCTT tại Phụ lục III.

• Đối với nội dung về giá trị trên hóa đơn điều chỉnh, người bán bắt buộc ghi số dương nếu điều chỉnh tăng và ghi số âm nếu điều chỉnh giảm, bảo đảm phù hợp với thực tế điều chỉnh.

c. Quy trình và văn bản thỏa thuận

• Đối với người mua là tổ chức, doanh nghiệp: Trước khi lập hóa đơn điều chỉnh hoặc thay thế, hai bên phải lập văn bản thỏa thuận ghi rõ nội dung sai.

• Đối với người mua là cá nhân: Người bán chỉ cần thông báo cho người mua hoặc thông báo trên website của người bán nếu có. Việc lập văn bản thỏa thuận không bắt buộc trong trường hợp này.

• Trường hợp tiếp tục phát hiện sai sót: Nếu hóa đơn đã được điều chỉnh hoặc thay thế mà vẫn tiếp tục phát hiện sai sót, các lần xử lý tiếp theo phải thực hiện theo hình thức đã áp dụng ở lần xử lý đầu tiên.

d. Xử lý trong các trường hợp đặc biệt

Thông tư 91 hướng dẫn cụ thể cách xử lý sai sót hoặc thay đổi đối với một số tình huống kinh doanh đặc thù:

• Điều chỉnh giá trị sau quyết toán: Đối với các dự án đầu tư khi có sự thay đổi về đơn giá, khối lượng theo kết luận của cơ quan nhà nước có thẩm quyền, người bán lập hóa đơn điện tử mới đối với số chênh lệch qua quyết toán, phản ánh đúng nghiệp vụ kinh tế phát sinh. Phát sinh giảm ghi số âm, phát sinh tăng ghi số dương phù hợp với thực tế.

• Chiết khấu thương mại: Căn cứ vào số lượng, doanh số hàng hóa đã bán, người bán lập hóa đơn điều chỉnh kèm bảng kê các số hóa đơn cần điều chỉnh.

• Trả lại hàng hóa: Trường hợp người mua trả lại một phần hoặc toàn bộ hàng hóa, người bán lập hóa đơn điều chỉnh. Nếu người mua là đối tượng sử dụng hóa đơn điện tử thì người mua cũng có thể lập hóa đơn trả lại hàng cho người bán.

• Hủy giao dịch: Khi phát sinh việc hủy hoặc chấm dứt cung cấp dịch vụ sau khi đã thu tiền và lập hóa đơn, người bán thực hiện điều chỉnh hóa đơn đã lập.

Trường hợp cơ quan thuế phát hiện sai sót trước, cơ quan thuế sẽ gửi thông báo theo Mẫu số 01/TB-RSĐT tại Phụ lục IV để người bán kiểm tra. Người bán có trách nhiệm rà soát và thực hiện điều chỉnh hoặc thay thế theo đúng quy định.

Cập nhật ký hiệu và mẫu hóa đơn mới

Thông tư 91/2026/TT-BTC bổ sung thêm các ký tự đặc thù trong ký hiệu hóa đơn nhằm phục vụ công tác quản lý chuyên sâu đối với từng loại hóa đơn.

Ký hiệu	Diễn giải
F	Hóa đơn giá trị gia tăng kiêm tờ khai hoàn thuế
X	Hóa đơn thương mại điện tử
26	Năm lập hóa đơn trong ký hiệu (dành cho năm 2026)

Việc bổ sung ký hiệu mới giúp cơ quan thuế phân loại, theo dõi và quản lý các loại hình hóa đơn đặc thù chính xác hơn. Doanh nghiệp cần cập nhật phần mềm hóa đơn điện tử, quy trình phát hành hóa đơn và tài liệu hướng dẫn nội bộ để tránh sử dụng sai ký hiệu hóa đơn.

Điều khoản chuyển tiếp và hiệu lực thi hành

Điều khoản chuyển tiếp

Thông tư 91/2026/TT-BTC quy định các nội dung chuyển tiếp nhằm bảo đảm việc chuyển đổi từ quy định cũ sang quy định mới không làm gián đoạn hoạt động lập, gửi, xử lý và lưu trữ hóa đơn điện tử.

• Đối với tổ chức cung cấp dịch vụ hóa đơn điện tử: Trường hợp tổ chức cung cấp dịch vụ hóa đơn điện tử đã ký hợp đồng với cơ quan thuế trước ngày Thông tư 91 có hiệu lực thì tiếp tục thực hiện theo các điều khoản của hợp đồng đã ký.

• Đối với hóa đơn đã lập theo Nghị định số 123/2020/NĐ-CP, Nghị định số 70/2025/NĐ-CP và Thông tư số 32/2025/TT-BTC: Việc điều chỉnh hoặc thay thế thực hiện theo quy định.

• Xử lý hóa đơn theo Nghị định cũ: Nếu phát hiện hóa đơn đã lập theo Nghị định 51/2010/NĐ-CP và Nghị định 04/2014/NĐ-CP bị sai sót sau khi đã chuyển sang sử dụng hóa đơn điện tử theo Thông tư 91, hai bên lập văn bản thỏa thuận sai sót. Người bán lập hóa đơn điện tử mới có mã hoặc không có mã để thay thế. Hóa đơn mới phải ghi rõ: “Thay thế cho hóa đơn Mẫu số… ký hiệu… số… ngày… tháng… năm”.

Hiệu lực thi hành

Thông tư 91/2026/TT-BTC có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01/07/2026. Kể từ thời điểm này, Thông tư 32/2025/TT-BTC ngày 31/05/2025 hết hiệu lực và được thay thế toàn bộ bởi Thông tư 91.

Thông tư 91 được ban hành kèm theo 05 phụ lục. Trong đó, Phụ lục I đến Phụ lục IV là các phụ lục bắt buộc áp dụng trong quá trình thực hiện; Phụ lục V mang tính tham khảo, hỗ trợ người nộp thuế, tổ chức và cá nhân trong quá trình áp dụng quy định.

Khuyến nghị của Atax dành cho doanh nghiệp

Để đáp ứng yêu cầu quản lý hóa đơn điện tử theo Thông tư 91/2026/TT-BTC, Atax khuyến nghị doanh nghiệp thực hiện một số công việc sau:

• Rà soát thông tin đăng ký thuế, thông tin người đại diện theo pháp luật, địa chỉ trụ sở và dữ liệu định danh liên quan.

• Kiểm tra lại quy trình đăng ký, phát hành, lập, gửi và lưu trữ hóa đơn điện tử.

• Cập nhật quy trình xử lý hóa đơn sai sót, đặc biệt là quy trình lập văn bản thỏa thuận, hóa đơn điều chỉnh, hóa đơn thay thế và bảng kê hóa đơn sai sót.

• Đào tạo bộ phận kế toán, bán hàng và chăm sóc khách hàng về nghĩa vụ lập và giao hóa đơn cho người mua.

• Làm việc với đơn vị cung cấp phần mềm hóa đơn điện tử để cập nhật ký hiệu hóa đơn mới, mẫu biểu mới và các yêu cầu kết nối dữ liệu.

• Lưu trữ đầy đủ chứng từ, biên bản, thông báo và tài liệu liên quan đến việc xử lý hóa đơn để phục vụ kiểm tra, thanh tra thuế khi cần thiết.

Kết luận

Thông tư 91/2026/TT-BTC đánh dấu bước hoàn thiện quan trọng trong khuôn khổ pháp lý về hóa đơn, chứng từ điện tử và quản lý thuế. Các quy định mới tập trung vào ứng dụng công nghệ, tăng cường xác thực thông tin, kết nối dữ liệu và nâng cao trách nhiệm tuân thủ của người nộp thuế.

Với vai trò là đại lý thuế chuyên nghiệp, Atax đồng hành cùng doanh nghiệp trong việc rà soát hồ sơ thuế, tư vấn quy trình hóa đơn điện tử, xử lý hóa đơn sai sót và cập nhật quy định mới. Doanh nghiệp nên chủ động chuẩn bị trước khi áp dụng để giảm thiểu rủi ro về thuế, bảo đảm chứng từ hợp lệ và duy trì hoạt động kế toán minh bạch, đúng quy định.

Xem thêm Nguyên tắc áp dụng ưu đãi thuế TNDN như thế nào?