Hướng dẫn chi tiết cách lập phụ lục chuyển lỗ mẫu 03-2/TNDN theo Thông tư 89/2026/TT-BTC

Chào mừng quý độc giả đến với chuyên mục tư vấn nghiệp vụ của Người Trợ Lý Atax. Trong công tác quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), việc xác định và chuyển lỗ đúng quy định là một trong những nghiệp vụ quan trọng nhằm tối ưu hóa nghĩa vụ thuế hợp pháp cho doanh nghiệp. Bài viết dưới đây Atax sẽ hướng dẫn chi tiết cách lập Phụ lục chuyển lỗ mẫu 03-2/TNDN ban hành kèm theo Thông tư số 89/2026/TT-BTC, đồng thời cập nhật các nguyên tắc chuyển lỗ mới nhất theo quy định pháp luật hiện hành.

Quy định và nguyên tắc chuyển lỗ theo Luật Thuế TNDN

Căn cứ theo quy định tại Khoản 1 Điều 16 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025 và hướng dẫn tại Nghị định số 320/2025/NĐ-CP, việc chuyển lỗ của doanh nghiệp cần tuân thủ các nguyên tắc cốt lõi sau đây:

1. Thời gian chuyển lỗ liên tục tối đa không quá 05 năm, kể từ năm tiếp theo năm phát sinh lỗ. Quá thời hạn 05 năm nêu trên, nếu số lỗ phát sinh chưa chuyển hết thì doanh nghiệp sẽ không được tiếp tục chuyển vào thu nhập chịu thuế của các năm tiếp theo.

2. Doanh nghiệp thực hiện tạm thời chuyển lỗ vào thu nhập của các quý trong năm khi xác định số thuế tạm nộp theo quý và thực hiện chuyển chính thức khi lập tờ khai quyết toán thuế TNDN năm.

3. Nguyên tắc chuyển lỗ phải đảm bảo tính liên tục, không bị gián đoạn. Trường hợp trong thời gian chuyển lỗ có phát sinh thêm khoản lỗ mới thì khoản lỗ mới này (không bao gồm số lỗ của kỳ trước chuyển sang) sẽ được tính riêng thời hạn chuyển lỗ tối đa không quá 05 năm kể từ năm tiếp theo năm phát sinh khoản lỗ mới đó.

4. Khoản lỗ phát sinh của năm nào phải được chuyển trước theo thứ tự thời gian. Ngoài ra, lỗ của hoạt động nào phải gắn liền với hoạt động kinh doanh đó (ví dụ hoạt động sản xuất kinh doanh thông thường hoặc hoạt động chuyển nhượng bất động sản), doanh nghiệp không được tự ý lựa chọn hoặc thay đổi thứ tự chuyển lỗ.

5. Trường hợp cơ quan thuế có thẩm quyền thực hiện kiểm tra, thanh tra và xác định số lỗ được chuyển khác với số liệu do doanh nghiệp tự xác định, doanh nghiệp thực hiện chuyển lỗ theo số liệu kết luận của cơ quan thanh tra, kiểm tra nhưng vẫn phải đảm bảo nguyên tắc chuyển liên tục không quá 05 năm.

Hướng dẫn chi tiết cách lập phụ lục chuyển lỗ mẫu 03-2/TNDN

Phụ lục chuyển lỗ mẫu 03-2/TNDN được lập kèm theo tờ khai quyết toán thuế TNDN mẫu số 03/TNDN quy định tại Phụ lục I ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC. Cách thức kê khai chi tiết các chỉ tiêu và các cột cụ thể như sau:

Kê khai các chỉ tiêu chung:

• Chỉ tiêu [01] (Kỳ tính thuế): Người nộp thuế ghi nhận kỳ tính thuế năm phù hợp với kỳ tính thuế đã khai trên Tờ khai quyết toán thuế TNDN mẫu số 03/TNDN.

• Chỉ tiêu [02] và [03] (Tên người nộp thuế và Mã số thuế): Ghi chính xác thông tin đăng ký thuế của doanh nghiệp. Đối với trường hợp kê khai qua hệ thống thuế điện tử, hệ thống eTax sẽ tự động hỗ trợ hiển thị thông tin này dựa trên tờ khai chính 03/TNDN.

Kê khai các cột chi tiết tại Mục I và Mục II:

• Cột (1): Ghi số thứ tự theo từng dòng kê khai.

• Cột (2): Ghi năm phát sinh lỗ. Mỗi năm phát sinh lỗ được trình bày riêng biệt trên một dòng tương ứng.

• Cột (3): Ghi tổng số lỗ phát sinh tương ứng với từng năm đã kê khai tại cột (2).

• Cột (4): Ghi số lỗ đã được chuyển trong các kỳ tính thuế trước tương ứng với từng năm phát sinh lỗ.

• Cột (5): Ghi số lỗ được chuyển trong kỳ tính thuế này tương ứng với từng năm phát sinh lỗ.

• Cột (6): Ghi số lỗ còn được chuyển sang các kỳ tính thuế sau. Số liệu tại cột này được xác định theo công thức: Cột (6) = Cột (3) – Cột (4) – Cột (5).

Phân loại kê khai theo từng mục hoạt động:

• Mục I (Lỗ của hoạt động sản xuất kinh doanh được chuyển trong kỳ): Dùng để kê khai các khoản lỗ từ hoạt động sản xuất kinh doanh thông thường. Tại chỉ tiêu [04], người nộp thuế kê khai tổng số lỗ hoạt động sản xuất kinh doanh được chuyển trong kỳ tính thuế này. Lưu ý giá trị tại chỉ tiêu [04] không được vượt quá thu nhập chịu thuế (chưa trừ chuyển lỗ) của doanh nghiệp sau khi đã trừ thu nhập miễn thuế trong kỳ. Số liệu này sẽ được ghi vào chỉ tiêu C3a của tờ khai quyết toán 03/TNDN.

• Mục II (Lỗ của hoạt động chuyển nhượng bất động sản được chuyển trong kỳ): Dùng để kê khai các khoản lỗ từ hoạt động chuyển nhượng bất động sản. Tại chỉ tiêu [05], người nộp thuế kê khai tổng số lỗ của hoạt động chuyển nhượng bất động sản được chuyển trong kỳ tính thuế này. Giá trị tại chỉ tiêu [05] không được vượt quá thu nhập chịu thuế của hoạt động chuyển nhượng bất động sản trong kỳ. Số liệu này sẽ được ghi vào chỉ tiêu D2 của tờ khai quyết toán 03/TNDN.

Quy định về tính Thuế Thu nhập doanh nghiệp

Căn cứ tại Điều 5 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025, kỳ tính thuế thu nhập doanh nghiệp được quy định rõ ràng như sau:

Kỳ tính thuế TNDN được xác định theo năm dương lịch (từ ngày 01/01 đến hết ngày 31/12) hoặc năm tài chính do doanh nghiệp tự lựa chọn. Đối với trường hợp doanh nghiệp áp dụng năm tài chính khác với năm dương lịch, doanh nghiệp có trách nhiệm thông báo bằng văn bản cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp trước khi đi vào thực hiện. Riêng một số trường hợp đặc thù khác sẽ thực hiện theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.

Trên đây là hướng dẫn chi tiết của Người Trợ Lý Atax về cách lập Phụ lục chuyển lỗ mẫu 03-2/TNDN theo Thông tư 89/2026/TT-BTC và các nguyên tắc pháp lý liên quan. Việc thực hiện đúng quy trình này không chỉ giúp doanh nghiệp tuân thủ nghiêm ngặt pháp luật thuế mà còn tránh được các rủi ro bị xử phạt hành chính khi cơ quan thuế thực hiện công tác thanh tra, kiểm tra quyết toán thuế TNDN.

Liên hệ trực tiếp cho ATAX qua fanpage ĐẠI LÝ THUẾ NGƯỜI TRỢ LÝ hoặc liên hệ trực tiếp Hotline: 0988 168 368 để được tư vấn HOÀN TOÀN MIỄN PHÍ.

Các chính sách mới áp dụng từ tháng 10/2026, Thuế suất GTGT 5% và quy tắc bù trừ thu nhập chịu Thuế TNDN