Hướng dẫn chi tiết khôi phục mã số thuế trạng thái 06 dành cho Doanh nghiệp

Chào Quý độc giả và Quý doanh nghiệp, trong quá trình vận hành doanh nghiệp, việc duy trì trạng thái hoạt động hợp pháp của mã số thuế (MST) là yếu tố cốt lõi để đảm bảo tính liên tục của các giao dịch kinh tế và tuân thủ đúng quy định pháp luật. Hiện nay, nhiều doanh nghiệp gặp phải tình trạng bị cơ quan thuế chuyển sang Trạng thái 06 – nghĩa là người nộp thuế không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký theo quy định tại Phụ lục 1 ban hành kèm theo Thông tư 90/2026/TT-BTC. Nhằm giúp doanh nghiệp nhanh chóng xử lý nghiệp vụ này một cách chuẩn xác, ATAX xin hướng dẫn chi tiết quy trình 5 bước và các trường hợp khôi phục mã số thuế theo đúng quy định pháp lý hiện hành.

Quy trình 5 bước khôi phục mã số thuế khi Doanh nghiệp ở trạng thái 06

Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ nội bộ doanh nghiệp

Trước khi tiến hành nộp hồ sơ lên cơ quan thuế, doanh nghiệp cần chủ động thực hiện kiểm tra và rà soát các nội dung sau:

• Kiểm tra địa chỉ hoạt động thực tế nhằm xác định và xác nhận lại địa chỉ kinh doanh sẽ hoạt động (giữ nguyên địa chỉ cũ hay chuyển sang địa chỉ mới).

• Rà soát toàn bộ nghĩa vụ kê khai và nghĩa vụ thuế để xác định rõ các tờ khai chưa nộp, số tiền thuế còn nợ, biên lai nộp thuế cũ, tình hình nợ thuế, tiền chậm nộp, cũng như các khoản phạt vi phạm hành chính về thuế hoặc hóa đơn phát sinh.

• Kiểm tra tình trạng hóa đơn bao gồm thông báo phát hành, báo cáo tình hình sử dụng hóa đơn hoặc các hóa đơn điện tử đang có sai sót cần điều chỉnh.

Bước 2: Nộp hồ sơ đề nghị khôi phục mã số thuế tại Cơ quan thuế quản lý trực tiếp

Người đại diện theo pháp luật, chủ hộ kinh doanh hoặc người được ủy quyền hợp pháp sẽ thực hiện nộp hồ sơ trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý. Hồ sơ pháp lý bao gồm: Văn bản đề nghị khôi phục mã số thuế theo Mẫu số 25/ĐKT ban hành kèm Thông tư 90/2026/TT-BTC. Đối với trường hợp có thay đổi địa chỉ hoặc thông tin đăng ký, người nộp thuế đồng thời thực hiện thủ tục thay đổi và cập nhật thông tin theo đúng luồng đăng ký của mình (thực hiện tại cơ quan Đăng ký kinh doanh đối với đối tượng liên thông, hoặc nộp trực tiếp tại cơ quan thuế đối với đối tượng đăng ký thuế trực tiếp).

Bước 3: Phối hợp với Cơ quan thuế kiểm tra thực tế tại địa chỉ (Xác minh trụ sở)

Giai đoạn này được thực hiện chặt chẽ qua hai bước công việc:

Cơ quan thuế lập danh sách nghĩa vụ kê khai, nộp thuế cần hoàn thành: Trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ đề nghị hợp lệ, cơ quan thuế sẽ lập Thông báo về việc các nghĩa vụ thuế phải hoàn thành trước khi khôi phục mã số thuế theo Mẫu số 19.1/TB-ĐKT để xác định các nghĩa vụ thuế, hóa đơn và các khoản phạt hành chính tính đến thời điểm nộp hồ sơ.

Cơ quan thuế tiến hành kiểm tra địa chỉ thực tế: Doanh nghiệp hoặc hộ kinh doanh phải thực hiện treo biển hiệu tại địa chỉ đăng ký theo đúng quy định pháp luật, người đại diện theo pháp luật hoặc người có thẩm quyền làm việc trực tiếp với cán bộ thuế và cung cấp đầy đủ hồ sơ, sổ sách chứng minh hoạt động thực tế. Sau khi hoàn thành việc xác minh thực địa, cơ quan thuế lập Biên bản xác minh tình trạng hoạt động tại địa chỉ trụ sở theo Mẫu số 15/BB-XMHĐ có xác nhận của chính quyền địa phương hoặc cơ quan có thẩm quyền, đồng thời người nộp thuế thực hiện ký xác nhận biên bản.

Bước 4: Hoàn thành nghĩa vụ thuế để được khôi phục trạng thái mã số thuế

Song song với việc xác minh địa chỉ, doanh nghiệp phải chủ động hoàn thành các nghĩa vụ tài chính và kê khai theo yêu cầu đối chiếu từ cơ quan thuế, bao gồm:

• Nộp đầy đủ các tờ khai thuế còn thiếu (GTGT, TNDN, TNCN…) tính đến thời điểm hiện tại

• Chấp hành quyết định xử phạt vi phạm hành chính đối với các hành vi chậm nộp hồ sơ khai thuế hoặc thay đổi thông tin đăng ký thuế không thông báo

• Nộp đầy đủ tiền phạt vi phạm hành chính, tiền nợ thuế, tiền chậm nộp và các khoản phải nộp khác vào Ngân sách Nhà nước.

Bước 5: Nhận thông báo khôi phục mã số thuế và cập nhật Hệ thống Đăng ký kinh doanh

Sau khi doanh nghiệp hoàn thành mọi nghĩa vụ và đủ điều kiện khôi phục, cơ quan thuế sẽ ban hành Thông báo về việc khôi phục mã số thuế theo Mẫu số 19/TB-ĐKT. Lúc này, trạng thái MST của doanh nghiệp trên hệ thống cơ quan thuế sẽ được khôi phục về trạng thái thực tế ban đầu trước khi chuyển sang trạng thái 06. Theo cơ chế liên thông, thông tin khôi phục MST sẽ tự động truyền sang Hệ thống thông tin quốc gia về đăng ký doanh nghiệp. Doanh nghiệp có thể kiểm tra trạng thái cập nhật trên cổng thông tin của Cục Thuế và tiếp tục thực hiện kê khai thuế, sử dụng hóa đơn điện tử cùng các giao dịch kinh tế hợp pháp.

Các trường hợp được phép khôi phục mã số thuế theo quy định

Theo quy định tại khoản 1 và khoản 2 Điều 17 Thông tư 90/2026/TT-BTC, các trường hợp được cơ quan thuế chấp thuận khôi phục mã số thuế bao gồm:

Người nộp thuế đăng ký thuế cùng với đăng ký kinh doanh theo cơ chế một cửa liên thông được khôi phục mã số thuế khi:

(1) Được khôi phục tình trạng pháp lý theo quy định của pháp luật về đăng ký kinh doanh

(2) Có hồ sơ đề nghị khôi phục mã số thuế gửi đến cơ quan thuế sau khi có thông báo không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký nhưng chưa bị thu hồi giấy phép và chưa bị chấm dứt hiệu lực mã số thuế

(3) Đơn vị phụ thuộc của doanh nghiệp hoặc hợp tác xã có nhu cầu tiếp tục hoạt động kinh doanh sau khi đã nộp hồ sơ chấm dứt hiệu lực mã số thuế theo quy định tại khoản 5 Điều 13 Thông tư 90/2026/TT-BTC gửi đến cơ quan thuế nhưng chưa nộp hồ sơ chấm dứt hoạt động đến cơ quan đăng ký kinh doanh.

Người nộp thuế đăng ký thuế trực tiếp với cơ quan thuế nộp hồ sơ đề nghị khôi phục mã số thuế đến cơ quan thuế quản lý trực tiếp khi:

(1) Được cơ quan có thẩm quyền ban hành văn bản hủy bỏ văn bản thu hồi giấy phép thành lập và hoạt động, quyết định thành lập hoặc giấy phép tương đương

(2) Có hồ sơ đề nghị khôi phục mã số thuế sau khi cơ quan thuế có thông báo người nộp thuế không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký nhưng chưa bị thu hồi giấy phép và chưa bị chấm dứt hiệu lực mã số thuế

(3) Có nhu cầu tiếp tục hoạt động kinh doanh sau khi đã nộp hồ sơ chấm dứt hiệu lực mã số thuế theo quy định tại khoản 7 Điều 13 Thông tư 90/2026/TT-BTC gửi đến cơ quan thuế nhưng cơ quan thuế chưa ban hành thông báo chấm dứt hiệu lực mã số thuế chính thức.

Lời khuyên từ ATAX:

Việc mã số thuế rơi vào trạng thái 06 gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến chuỗi cung ứng, xuất hóa đơn và uy tín của doanh nghiệp đối với đối tác. Do đó, việc nắm rõ quy trình nghiệp vụ và phối hợp chặt chẽ với cơ quan quản lý thuế là vô cùng quan trọng để giảm thiểu tối đa các rủi ro pháp lý và chi phí phạt phát sinh. Nếu Quý doanh nghiệp gặp bất kỳ khó khăn nào trong quá trình thực hiện thủ tục khôi phục mã số thuế, Người trợ lý ATAX luôn sẵn sàng đồng hành, tư vấn và hỗ trợ xử lý hồ sơ một cách chuyên nghiệp, nhanh chóng và chính xác nhất.

Lưu ý và hướng dẫn xử phạt hành chính đối với Doanh nghiệp ở trạng thái mã số Thuế 03 và 06

Liên hệ trực tiếp cho ATAX qua fanpage ĐẠI LÝ THUẾ NGƯỜI TRỢ LÝ hoặc liên hệ trực tiếp Hotline: 0988 168 368 để được tư vấn HOÀN TOÀN MIỄN PHÍ.